Фамилия Лыпкина — женская форма фамилии Лыпкин. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы прозвища или имени с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — Лыпкин, то есть сын Лыпки). Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Лы́пкина.

Корень фамилии — «лып-» — редкий и неочевидный. В современных говорах и литературном языке слова с таким корнем почти не встречаются, поэтому происхождение приходится восстанавливать по косвенным данным. Самая вероятная версия: основа связана с диалектным глаголом «лыпать» или «лыпнуть», который в некоторых северных и сибирских говорах означал «ударить», «хлестнуть», «шлёпнуть» (ср. также «лып» — звук удара, как «шлёп»). Тогда Лыпка — это прозвище человека, который мог быть резким, драчливым или, наоборот, получившим его по какому-то памятному удару.

Менее распространённая, но тоже возможная версия: «лып-» — вариант корня «лыс-» (лысый). В некоторых диалектах, особенно в южнорусских, происходит замена «с» на «п» под влиянием соседних звуков или просто как особенность произношения. В этом случае Лыпка — то же, что Лыска, то есть прозвище лысого человека. Однако эта версия слабее: переход «с» в «п» нетипичен для русского языка, и примеров таких фамилий мало.

Фамилия Лыпкин (и Лыпкина) встречается редко и имеет чёткую географическую привязку. По данным современных телефонных справочников и архивных записей, большинство носителей живёт в Удмуртии и Кировской области. Это указывает на то, что прозвище Лыпка возникло именно в севернорусской или вятской диалектной среде, где глагол «лыпать» был в ходу. Сословного барьера у фамилии нет: Лыпкиными могли быть и крестьяне, и мещане, и священники — прозвище давали по внешности или поведению, а не по роду занятий.