Фамилия Липкины — и её мужская форма Липкин — имеет как минимум два объяснения, и оба заслуживают внимания. Первое и наиболее вероятное: в основе лежит не дерево, а имя. Липка — это краткая, обиходная форма от старых крестильных имён Олимпий (греч. «гора богов») или Алимпий. В устной речи звук «м» в этих длинных именах часто опускали для удобства, так и появилось простое Липка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Липкин, то есть сын или потомок человека по имени Липка. Именины Олимпия отмечают 30 июля, Алимпия — 9 июня.

Вторая версия связывает фамилию с названием дерева липа. В этом случае прозвище Липка мог получить плотник, работавший с мягкой липовой древесиной, или мастер, плевший лапти из липового лыка. Такие прозвища по роду занятий были обычным делом, и они легко закреплялись в качестве фамилий у потомков.

Обе гипотезы не противоречат друг другу: в разных семьях фамилия могла возникнуть независимо по разным причинам. Но лингвистически версия с личным именем выглядит предпочтительнее, так как модель «имя + -ин» — одна из самых массовых в русской ономастике, а вот прозвища от названий деревьев чаще оформлялись суффиксом -ов (Липов, Липкин встречается реже).

Среди известных носителей — Семён Израилевич Липкин (1911–2003), русский поэт, прозаик и переводчик. Точное время и место возникновения фамилии установить сложно: процесс становления фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий, и фамилия Липкин могла появиться и в XVI, и в XIX веке.