Фамилия Липкин чаще всего происходит от имени Липка — так в быту могли называть человека с полным именем Олимпий (от греческого «гора богов») или Алимпий. Чтобы упростить произношение, звук «м» в этих именах опускали, и получалось короткое и удобное Липка. Именины Олимпия — 30 июля, Алимпия — 9 июня. Потомок человека по имени Липка и получал фамилию Липкин.

Но есть и вторая версия: корень «лип» мог указывать на дерево липу. Липу на Руси использовали повсеместно — из неё делали лапти и плотничали. Поэтому Липкиным могли прозвать мастера по липовой древесине, лапотника или плотника. Какая из версий верна для конкретной семьи, без родословной не скажешь, но обе имеют право на жизнь.

Самый известный носитель фамилии — Семён Израилевич Липкин (1911–2003), русский поэт, прозаик и переводчик, автор мемуаров. В остальном фамилия не слишком распространена, но встречается и у русских, и у еврейских семей — в последнем случае её часто связывают с местечком Липки или с тем же деревом, но уже в идишской среде.