Фамилия Лыськов звучит так, будто предок её носителя был лысым. И это первая, самая очевидная версия, но не единственная. В основе действительно лежит прозвище Лысый или Лысько, а суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей сын?» — Лыськов. Однако в русских говорах у слова «лысь» было и другое значение — «плешина», «прогалина в лесу», «открытое место». Человек мог получить прозвище Лысь не только из-за отсутствия волос, но и по месту жительства — на расчищенном участке, на лысине среди леса.

Словообразовательная модель здесь не совсем обычная. Фамилия образована не напрямую от прилагательного «лысый» (тогда была бы форма Лысов), а от более редкой основы «лысь» с суффиксом -к-. Такая модель типична для украинских и южнорусских фамилий: Лысько, а затем, при русификации, Лыськов. Это косвенно указывает на возможное происхождение рода из южных областей России или с Украины, где форма Лысько как прозвище была распространена шире, чем в северных говорах.

Более редкая версия отсылает к древнерусскому некалендарному имени Лысь. В дохристианской Руси имена по внешним признакам (Косой, Хромой, Лысь) давали не в обиду, а как оберег: считалось, что злые духи не позарятся на такого ребёнка. Если принять эту версию, фамилия Лыськов — одна из многих, сохранивших память о древнем имени-прозвище.

В ономастических словарях фамилия Лыськов не относится к числу широко изученных, в отличие от более частотных Лысов или Лысенко. Это редкий случай, когда прозвище закрепилось в форме с суффиксом -к- и затем было адаптировано стандартным патронимическим суффиксом -ов. Споров между версиями нет: основная — прозвище по признаку лысины, дополнительная — по месту жительства на лесной прогалине. География фамилии размыта, но чаще встречается в Поволжье и центральных областях России, что согласуется с миграцией населения из южных регионов.