Фамилия Лыськовы — одна из тех, где корень говорит сам за себя, но не всё так прямолинейно. В её основе лежит слово «лысый», и первая мысль — предка так прозвали за отсутствие волос. Однако в русских говорах у слова «лысь» было и другое значение: так называли плешь, проплешину в лесу или на поле, а также белую отметину на лбу у животных (например, у лошади или коровы). Прозвище Лысько мог получить не только лысый человек, но и тот, кто жил на опушке, у «лысого» места, или владел скотиной с характерной отметиной.

Фамилия образована по типичной восточнославянской модели: прозвище Лысько + суффикс -ов, дающий фамилию Лыськов. Форма на -ко (Лысько) в XVI–XVII веках была очень распространена на украинских и южнорусских землях, особенно в Черниговщине, Полтавщине, на Слобожанщине. Оттуда носители прозвища вместе с переселенческими потоками могли попасть и в центральные области России. Форма множественного числа «Лыськовы» закрепилась как родовая — так в документах записывали целые семьи.

Среди однокоренных фамилий — Лысов, Лысых, Лысенко, Лысаков. Лыськовы стоят особняком из-за суффикса -к-, который в прозвищах часто придавал оттенок уменьшительности или принадлежности: Лысько — это не просто «лысый», а «тот, кого так прозвали», с оттенком бытовой фамильярности. В некоторых говорах слово «лысько» зафиксировано и как название белой лысины на лбу лошади, что добавляет ещё один возможный источник прозвища — по примете животного, а не человека.

Сословная принадлежность Лыськовых не зафиксирована в дворянских родословных книгах, что типично для фамилий, образованных от прозвищ: скорее всего, это крестьянский или казачий род. Встречаемость фамилии невысокая, она сосредоточена в основном в Курской, Белгородской и Воронежской областях — то есть в зоне исторического расселения южнорусского населения, где прозвища на -ко были обычным делом.