Фамилия Мачерко звучит необычно для русского уха, и это не случайно. В её основе лежит украинское или белорусское прозвище, а суффикс -ко выдает южное или западное происхождение носителя. В восточнославянской ономастике -ко — это уменьшительно-ласкательный суффикс, характерный для украинских и белорусских фамилий (сравните: Шевченко, Коваленко, Бойко). Так что предок человека с фамилией Мачерко, скорее всего, жил на территории современной Украины или юго-западной Беларуси.

Корень «мач-» в прозвище мог возникнуть двумя путями. Первый и самый очевидный — от слова «мачта». Прозвище Мачта или Мачтарь могли дать высокому, долговязому человеку, похожему на корабельную мачту. Либо же оно указывало на ремесло: плотника, который ставил мачты, или моряка, ходившего на судне с высокими мачтами. Вторая версия менее распространена, но возможна: связь с польским словом «macocha» (мачеха) или украинским «мачуха». В таком случае прозвище Мач(е)ра могли дать пасынку или человеку, воспитанному мачехой, либо, напротив, суровой женщине, от имени которой фамилия перешла к детям.

Словообразовательная модель проста: к основе прозвища Мачер (или Мач(е)ра) добавили уменьшительный суффикс -ко. Так получилось Мачерко — «маленький Мачер» или «сын Мачера». Фамилия недворянская, крестьянская или казацкая, и в дореволюционных списках её носители, вероятно, числились в малороссийских губерниях. Встречается она и сегодня, но редко — в основном на Украине, в южных областях России и среди потомков эмигрантов.

В русском языке фамилию часто склоняют как существительное (Мачерко, Мачерка, Мачерку), хотя по правилам украинские фамилии на -ко обычно не склоняются в мужском роде. Но в бытовой речи оба варианта допустимы.