Фамилия Маджуго — одна из тех, что сразу выдают южное, скорее всего украинское или молдавское происхождение. Её основа — не славянское имя или прозвище, а тюркское или румынское слово, что для южнорусских и причерноморских фамилий обычное дело.

Ключ к разгадке — суффикс «-уго». В украинской ономастике он встречается редко и часто указывает на румынское (молдавское) влияние. Сравните с фамилиями Карабуго, Мазурго, где «-го» — это адаптация румынского окончания или остаток тюркского слова. Сама основа «Мадж» восходит к тюркскому «madj» — «маг», «волшебник», или к румынскому «maj» — «печень», «внутренности» (в переносном смысле — «нутро», «суть»). Правдоподобнее первая версия: в тюркских языках «мадж» — человек, владеющий тайными знаниями, знахарь. Прозвище Маджуга могли дать либо колдуну, либо человеку с необычным, «магическим» поведением.

Фамилия образована по продуктивной для Украины модели: прозвище + суффикс «-о», который в украинском языке часто оформляет фамилии без дополнительных окончаний (как Бойко, Швець, Мажуга). Вариант Маджуго — это та же основа, но с характерным для южнорусских говоров окончанием «-о», которое могло закрепиться при русификации документа. Таким образом, Маджуго — это «сын Маджуги» или просто «тот, кого прозвали Маджуга».

Географически фамилия тяготеет к Одесской, Николаевской областям Украины и к Молдове. В российских архивах встречается редко, в основном среди переселенцев конца XIX — начала XX века. Сословной привязки нет: носители могли быть и казаками, и крестьянами, и мещанами.

Из-за редкости фамилии и отсутствия массовых документальных свидетельств (например, в боярских книгах или ревизских сказках центральной России) точная дата её появления не установлена. Вероятно, она оформилась в XVII–XVIII веках на землях Дикого поля, где смешивались славянские, тюркские и романские элементы.