Фамилия Маганбетова — женская форма мужской фамилии Маганбетов. Её основа — имя Маганбет, которое состоит из двух тюркских корней: «маган» (в значении «мне», «для меня») и «бет» (в значении «лицо», «лик», «счастье»). В казахской и башкирской антропонимии сложносоставные имена с компонентом «бет» (например, Айбет, Кунбет) часто были пожелательными: родители давали такое имя, чтобы ребёнок был удачливым, «лицом к счастью». Получается, что Маганбет дословно можно перевести как «счастье для меня» или «мой счастливый лик». Фамилия образована по классической русской модели: к основе имени добавили суффикс -ов (в женском варианте -ова). Это типичная «притяжательная» фамилия, которая буквально отвечала на вопрос «Чей ты?» — из рода человека по имени Маганбет.

Поскольку фамилия распространена в Казахстане и среди башкир, её носители, скорее всего, происходят из тюркоязычной среды. Массовое закрепление таких фамилий у казахов произошло в XIX — начале XX века, когда при переписях и паспортизации русские чиновники записывали имена отцов как фамилии для всего рода. Поэтому предки современных Маганбетовых — это рядовые кочевники или оседлые крестьяне, которых в документах просто обозначили по имени главы семьи. Дворянского происхождения у этой фамилии нет: в тюркской среде знатные люди чаще получали фамилии на -ский или сохраняли родовые имена без русификации.

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий, где суффикс -ов указывает на принадлежность (Иванов — сын Ивана), здесь он наложился на уже готовое имя, которое само по себе было пожелательным. То есть фамилия Маганбетова несёт в себе двойной смысл: и указание на предка, и древнее пожелание счастья, заложенное в имени. Сравните с похожими по модели фамилиями: Магамбетов, Маханбетов — все они восходят к разным вариантам одного и того же имени, где менялся первый корень, а второй оставался неизменным. Встречаются и более редкие написания через «а» — Маганбетова, но это уже особенности локального произношения или записи в паспорте.