Фамилия Магергут — редкий пример составной немецкой фамилии, которую в России не перевели на русский лад, а сохранили в исходном виде. Её разбирают на две части: «магер» и «гут». Первая, скорее всего, восходит к немецкому Macher — «мастер, работник» (через диалектное произношение). Вторая — к Hut — «шляпа, колпак». Вместе прозвище Магергут буквально означало «шляпный мастер», то есть указывало на ремесло: предок носителя фамилии был шляпником.

Такие двухосновные прозвища типичны для немецкой ономастики, но в русской среде они встречаются редко. Обычно их приносили переселенцы из немецких земель, оседавшие в России с XVIII века. Фамилия могла закрепиться в семьях ремесленников, работавших с головными уборами, — либо в среде городских цеховых, либо среди колонистов, которых приглашали в Поволжье и Новороссию.

Поскольку фамилия не русифицирована (нет суффиксов -ов, -ин, -ский), её носители, вероятно, долго сохраняли немецкое самосознание или жили в обособленных общинах. Встречаемость фамилии в России крайне низкая, что подтверждает её локальный характер. В отличие от однокоренных фамилий вроде Махер или Гутмахер, форма Магергут застыла как цельное прозвище, не переоформленное по славянским моделям.