Фамилия Магилинский происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Магилинский образована от прозвища Могилинский. Оно же, скорее всего, восходит к названию села Могилино, расположенного в Русенской области Болгарии. Сам топоним, предположительно, происходит от русского слова «могила», которое в старину употреблялось в значении «курган, холм». Таким образом, вполне вероятно, что основатель рода Магилинских был выходцем из этого населенного пункта. Изменение, произошедшее в графическом облике фамилии Магилинский (чередование гласных а/о), объясняется влиянием акающих говоров. О точном месте и времени возникновения фамилии Магилинский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Магилинский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.