Фамилия Магзимов, вероятно, образована от имени Магзим, которое восходит к киргизскому слову «максым». Оно имеет два значения: «кислое питье, приготовляемое из дробленого ячменя без солода» и «сын большого муллы или влиятельного духовного лица». Однако не исключено, что Магзим – это прозвище, которое указывало на род занятий или любимое блюдо предка или же его социальный статус. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.