Фамилия Маканеева — женская форма, а мужская, Маканеев, образована от прозвища или имени, которое в основе своей звучало как Маканей. Сразу видна тюркская модель: суффикс -ей, характерный для личных имён и прозвищ в татарской, башкирской и других тюркских средах. В русскую фамильную систему такие основы вошли через контакты с народами Поволжья и Приуралья, где фамилии на -еев (от тюркских Мамай, Ахмет, Сабан) встречаются сплошь и рядом.

Корень «макан» в тюркских языках означает «место», «жилище», «стоянка». Прозвище Маканей могли дать человеку, который часто менял место жительства, кочевал или, наоборот, был привязан к одному определённому становищу. Вторая версия — от арабского имени Макан (с ударением на второй слог), которое в мусульманских семьях давали в честь святого или как пожелание прочного положения. Тогда Маканей — это уменьшительно-ласкательная форма, а фамилия Маканеев — «сын Маканея».

С точки зрения словообразования фамилия типична для русского Заволжья и Южного Урала. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировали у служилых татар, башкир и даже у русских крестьян, живших по соседству. Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивается на мягкий согласный или йот, что и подтверждает тюркское происхождение.

Сегодня носители фамилии встречаются в Челябинской, Оренбургской областях, в Башкортостане и Татарстане. Если ваши предки Маканеевы — скорее всего, они были либо кочевниками-скотоводами, либо оседлыми крестьянами, но с явным восточным следом в родословной.