Основой фамилии Маханьков послужило мирское имя Маханький. По одной из версий, фамилия Маханьков образована от мирского имени Маханький. Однако не исключено, что в основе фамилии лежит прозвище Маханький. В таком случае Маханьким могли прозвать человека невысокого роста. Наконец, фамилия Маханьков может восходить и к прозвищу Маханько (от украинского слова «махан» - «конина для кормления собак», «баранье мясо; мясо вообще»). В таком случае основатель рода Маханьковых мог быть мясником или торговал мясом. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Маханький, со временем получил фамилию Маханьков.