Фамилия Махнаткин — из тех, где основа сразу наталкивает на догадку, но догадка эта неполная. Корень здесь — «мохнатый», и действительно, в основе лежит прозвище Мохнатка. Так в русских говорах называли человека с густыми, торчащими волосами, лохматого, неопрятного на вид. Но это не единственное значение. В некоторых диалектах «мохнаткой» называли мохнатую рукавицу, а в переносном смысле — неуклюжего, нерасторопного человека. Фамилия, таким образом, могла закрепиться за кем угодно: от лохматого крестьянина до того, кто носил мохнатые варежки или славился медлительностью.

Обратим внимание на суффикс. Махнаткин — это не типичное -ов/-ев, а -ин. Такая модель в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей сын?» — Махнаткин, то есть сын Махнатки. Суффикс -ин чаще встречается у фамилий, образованных от слов женского рода на -а/-я (Махнатка — женский род, хотя прозвище могли дать и мужчине). Это делает фамилию характерной для северных и центральных областей России, где патронимические формы на -ин особенно распространены. В южных регионах скорее бы появился вариант Махнатков.

Географически фамилия редкая, но встречается в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её народное, недворянское происхождение. Среди носителей не было известных исторических деятелей, но это типичная крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали по внешности или повадкам. Интересно, что в старых документах можно встретить двоякое написание: и Махнаткин, и Мохнаткин. Смена «о» на «а» — результат аканья, когда безударный звук произносился как «а» и со временем закрепился на письме. Поэтому, если встретите Мохнаткина, знайте: это не другая фамилия, а вариант того же корня.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Махнатов, Махнач, Махнов — Махнаткин стоит особняком из-за уменьшительного суффикса -к-. Прозвище Мохнатка звучит более обиходно, по-домашнему, чем просто Мохнатый. В этом чувствуется не столько насмешка, сколько бытовая меткость: так могли окликнуть парня или мужика в деревне, и прозвище приклеилось намертво. Иных версий, кроме «мохнатый», у фамилии нет — экзотические тюркские или финно-угорские корни здесь не просматриваются, всё лежит на поверхности народной речи.