Фамилия Маковы (в мужском роде — Маков) образована от имени или прозвища Мак. Разберёмся, что стоит за этой основой и какую модель словообразования здесь видим.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — «Маков», то есть сын или потомок человека по имени (или прозвищу) Мак. В старину маком могли назвать ребёнка по языческому обычаю — давая мирское имя от названия растения. Славяне верили: назвав сына Маком, родители как бы вверяли его природе, надеясь, что к нему перейдут свойства этого цветка. Мак считался и оберегом от нечистой силы (с его помощью, по поверьям, распознавали ведьму), и символом изобилия — мелкие маковые зёрна ассоциировались с богатством и плодородием.

Вторая, не менее правдоподобная версия — прозвищное происхождение. Ма́ком могли прозвать человека, который выращивал мак или торговал им. В крестьянском быту такие прозвища по роду занятий были обычны и легко переходили в фамилии. Обе гипотезы не противоречат друг другу: и в том, и в другом случае фамилия Маков (Маковы) восходит к одному корню — названию растения.

Из известных носителей фамилии — Лев Саввич Маков (1830–1883), министр внутренних дел Российской империи в 1879–1880 годах. О точном времени и месте возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий был долгим, и Маковы могли появиться независимо в разных регионах. Фамилия эта — нередкая, встречается у русских, украинцев и белорусов. Сравните с однокоренными: Маковей, Маковецкий, Макухин — все они отталкиваются от того же «мака», но через разные суффиксы и модели.