Фамилия Макринская принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от прозвищ с помощью суффикса -ск-. Этот суффикс указывает на принадлежность к роду, месту или на связь с носителем исходного прозвища. В основе фамилии лежит мирское имя или прозвище Макрина.

Самая прямая и убедительная версия связывает Макрину с прилагательным «мокрый». Человек, которого прозвали Макриной, мог в детстве часто ходить мокрым, либо его дом стоял на сыром, болотистом месте. Замена корневой гласной «о» на «а» (мокрый → Макрина) — явление обычное для русской ономастики: оно могло возникнуть из-за реального акающего произношения в южнорусских говорах или же из-за ошибки писаря, записавшего прозвище на слух.

Существует и вторая гипотеза, менее правдоподобная с точки зрения словообразования. Согласно ей, Макрина — это просторечная форма нецерковного имени Макрида. Это имя, в свою очередь, связывают с древним обрядом жертвоприношения богине Мокоши, который назывался «мокриды» или «макриды». Однако эта версия сложнее и требует дополнительных допущений о том, как именно от имени Макрида образовалось прозвище Макрина, тогда как связь с «мокрым» лежит на поверхности и не требует лишних объяснений.

Скорее всего, предок носителей фамилии Макринская — человек, получивший уличное прозвище Макрина из-за сырости, будь то его одежда или место жительства. Фамилия закрепилась за его потомками, когда те перешли к постоянному родовому именованию.