Фамилия Макутенас — редкий случай в русском ономастиконе. Сразу бросается в глаза её нетипичное для славянских фамилий окончание -ас. Это верный признак литовского происхождения. В Литве фамилии мужского рода в именительном падеже часто оканчиваются на -ас, -ис, -ус (например, Макутенас, Будрис, Паулаускас). Таким образом, перед нами не результат русского суффиксального словообразования, а готовая литовская фамилия, которая могла попасть в русский контекст через миграцию, браки или исторические процессы на западных границах империи.

Основа фамилии — Макут- (Makūt-). Она восходит к литовскому слову makūtė или makutas, что значит «голова», «макушка», «вершина». В диалектах и разговорной речи так могли называть человека с заметной головой — крупной, круглой или просто выделяющейся формой. Литовские прозвища по внешним признакам — обычное дело, и фамилия Макутенас, скорее всего, закрепилась за предком, которого в деревне прозвали «головачом» или «макушкой». Суффикс -енас (лит. -ėnas) в литовских фамилиях часто указывает на принадлежность или происхождение: Макутенас буквально означает «сын Макутаса» или «человек из рода Макутисов».

В русском языковом пространстве эта фамилия почти не встречается — её можно найти лишь в единичных записях, в основном среди литовцев или потомков выходцев из Литвы (например, в Калининградской области, на северо-западе Беларуси). Если ваш предок носил фамилию Макутенас, он почти наверняка был литовцем по происхождению, а сама фамилия — не крестьянское прозвище, а вполне официальная литовская родовая форма, которая не переделывалась под русский суффикс -ов или -ин. Это редкий пример, когда фамилия сохранила свою национальную «огранку» без русификации.