Фамилия Малакичева — женская форма мужской фамилии Малакичев. В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Малакич, которое, в свою очередь, образовано от прилагательного «малакий» (вариант — «малакитный»). В русских говорах это слово имело два основных значения. Первое, самое распространённое, — «мягкий, нежный, изнеженный, слабый». Второе, более редкое, — «смирный, кроткий, уступчивый». Таким образом, Малакичем могли прозвать человека с мягким характером, покладистого, либо, наоборот, дать ироничное прозвище человеку суровому, как это часто бывает в народной традиции.

Словообразовательная модель типична для русского севера и северо-востока. Суффикс -ич здесь указывает на отчество или прозвище по отцу (Малакич — сын Малаки), а фамильный суффикс -ев присоединяется к основе, оканчивающейся на шипящий или мягкий согласный. Форма Малакичев, а не Малакичов, закрепилась под влиянием церковнославянской традиции написания (после шипящих под ударением писалось «о», а в безударной позиции — «е»). Аналогичные фамилии — Малахов (от Малах), Малафеев (от Малафей), но в данном случае основа не от греческого имени, а от чисто русского нарицательного слова.

Географически фамилия Малакичева (и её мужской вариант) тяготеет к Вологодской, Архангельской и Кировской областям, а также к Пермскому краю. Это зона бытования так называемых «северорусских» фамилий на -ев, -ов и -ин, часто образованных от прозвищ. В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян и посадских людей с этим прозвищем, но массовый характер фамилия приобрела уже после отмены крепостного права, когда бывшие помещичьи и государственные крестьяне получали постоянные фамилии.

Отдельно стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к греческому слову «малакия» (слабость, порок) или к минералу малахиту. Это народное, бытовое имя, и его значение следует искать в диалектной лексике Русского Севера. В советское время фамилия могла подвергаться переосмыслению, но её исконный смысл — характеристика мягкого, покладистого нрава предка.