Фамилия Малиновцев — редкий случай, когда на одно окончание претендуют сразу две разные модели образования, и обе имеют право на существование. Разберём их по порядку.

Первая версия отталкивается от мирского имени Малина. В дохристианской Руси такие «растительные» имена были в ходу: Малиной могли назвать ребёнка в честь ягоды, не вкладывая в это ботанического смысла, а скорее желая ему красоты, румянца или сладкого нрава. Прозвище Малина закреплялось и за взрослым — за миловидного человека, щеголя или, наоборот, сентиментального и мягкого. Есть и версия, что корень здесь не «малина», а «мал-» (маленький), но она слабее: форма Малина при таком значении маловероятна, скорее бы дали Малюта или Малыш. Если исходить из этой линии, то фамилия строится так: Малина → отчество Малинов (чей сын?) → суффикс -цев, указывающий на принадлежность: «сын Малинова». То есть Малиновцев буквально означает «внук (или потомок) Малины».

Вторая версия — топонимическая. Фамилия могла пойти от прозвища Малиновец, которое получал выходец из села или деревни с названием Малиново, Малиновка. Таких топонимов по России десятки, и связаны они, конечно, с зарослями малины. Переселенцам часто давали прозвище по покинутой местности: «откуда ты?» — «из Малиновки», вот и пошёл Малиновец. А его сыновья и внуки уже становились Малиновцевыми. В этом случае фамилия образована по той же модели, что и, скажем, Ростовцев (от Ростовец) или Твердовцев (от Твердовец): суффикс -ов- здесь часть прозвища, а -цев — патронимический.

Какая версия правдоподобнее? Обе рабочие, но вторая — прозвище от названия местности — встречается в русских фамилиях чаще, чем отыменная модель с двойным суффиксом. Фамилии на -цев обычно как раз и образуются от прозвищ на -ец (кузнец → Кузнецов, стрелец → Стрельцов). Так что Малиновцев, скорее всего, пошёл от «малинового» переселенца, а не от ягодного имени. Впрочем, без конкретной родословной обе версии остаются равновероятными — и это как раз тот случай, когда фамилия хранит сразу две возможные истории предка.