Фамилия Маллахожаева — одна из тех, что сразу привлекает внимание непривычным для русского уха сочетанием корней. Её основа — явно восточная, и разобрать её стоит именно с позиции словообразовательной модели, которая сложилась на стыке разных языковых традиций.

Корень фамилии — составное имя «Малла-Хожа». Первая часть, «Малла», восходит к арабскому «мавла» (господин, владыка) или к тюркскому «молла» (грамотный человек, священнослужитель). Вторая часть, «Хожа» (чаще пишется как «Ходжа»), — почётный титул, означающий «господин», «хозяин», «наставник». У народов, исповедующих ислам, «ходжа» — это не просто имя, а указание на происхождение от арабских проповедников или на принадлежность к духовному сословию. Таким образом, двусоставное имя Малла-Хожа — это фактически «господин-наставник» или «учёный ходжа», то есть имя-удвоение, подчёркивающее высокий статус.

Фамилия образована по русской патронимической модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или шипящий. В данном случае основа «Маллахожа» (на письме с удвоенной «л» — частая особенность передачи восточных имён в русской записи) даёт фамилию Маллахожаев. Окончание -а указывает на женскую форму. Мужской вариант, соответственно, — Маллахожаев.

Носители фамилии — почти исключительно представители чеченского и ингушского народов. Именно в вайнахской среде эта фамилия получила распространение. Здесь важно понимать, что у чеченцев и ингушей фамилии (тайповые или родовые) нередко закрепляли за семьёй прозвище или имя основателя рода. Скорее всего, предок носителя фамилии Маллахожаевых был человеком духовного звания — муллой или ходжой, которого в округе так и звали: Малла-Хожа. Со временем это именование превратилось в родовое.

Географически фамилия привязана к Северному Кавказу, в первую очередь к Чечне и Ингушетии. Встречается она и среди чеченской диаспоры. Поскольку фамилия редкая и несёт ярко выраженную этническую окраску, её носители, как правило, хорошо осведомлены о своём родовом корне и связи с определённым тейпом.

С точки зрения ономастики, фамилия Маллахожаева — яркий пример того, как русский суффикс -ев накладывается на сложное восточное имя, создавая фамилию, которая одновременно говорит и о социальном положении предка, и о регионе его происхождения. Никаких других версий, кроме указанной (связь с духовным титулом), у этой фамилии нет — основа прозрачна и не вызывает споров.