Фамилия Малякова образована от мирского имени или прозвища Маляк. В основе лежит прилагательное «малый», «маленький». Скорее всего, так называли младшего ребёнка в семье — по старой русской традиции давать детям нецерковные имена по порядку рождения или по внешним признакам. Не исключено, что имя Маляк получал новорождённый с маленьким весом и ростом.

Есть и вторая версия: Маляк — прозвище, которое закреплялось за взрослым человеком невысокого роста и указывало на его внешность. В этом случае фамилия фиксировала не детское имя, а устойчивую характеристику, данную в коллективе.

Фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ов(-а), который в русском языке чаще всего присоединялся к именам и прозвищам, оканчивающимся на твёрдый согласный: Маляк → Маляков. Окончание -а указывает на женскую линию рода или на форму родительного падежа в разговорной речи (в значении «дочь или жена Малякова»).

Интересно, что корень «мал-» дал множество схожих фамилий: Малых, Малкин, Малеев, Малютин. Но Маляков стоит особняком — суффикс -як в основе (Маляк) встречается реже, чем -ык или -ик, и характерен скорее для северных и восточных русских говоров. В некоторых диалектах «маляк» означало не просто «маленький», а «коротышка» или «недоросль» — с оттенком пренебрежения или насмешки.

Исторически фамилия Малякова могла принадлежать крестьянам или мещанам: именования по внешним признакам были распространены в низших сословиях, где фамилии закрепились позже, чем у дворянства. Географически фамилия встречается в Поволжье, на Урале и в Сибири — регионах позднего заселения, куда переселенцы приносили свои прозвища.

Таким образом, потомок человека по имени или прозвищу Маляк со временем получил фамилию Малякова, и сегодня она хранит память о предке, которого в семье или в деревне отличали за малый рост или младший возраст.