Фамилия Малюцкий — редкий пример, где суффикс -цк- указывает не на польское или дворянское происхождение, а на украинскую или белорусскую почву. В восточнославянской ономастике фамилии на -цкий чаще всего образовывались от названий мест (сел, урочищ) или от прозвищ с уменьшительным суффиксом. В случае с Малюцким основа — «малый», то есть невысокий, младший по возрасту или положению.

Скорее всего, перед нами прозвище Малюк или Малюта, которое носил человек небольшого роста либо младший в семье. Суффикс -ук/-юк (в белорусском и украинском варианте) дал форму Малюк, а затем добавление -цк- превратило её в фамилию по модели «чей?» — Малюцкий, то есть «сын или потомок Малюка». Такая словообразовательная цепочка характерна для земель современной Беларуси и западной Украины, где фамилии на -цкий нередко бытовали среди крестьян и мещан, а не только шляхты.

Версия о происхождении от названия населённого пункта, например, Малюцы или Малюцкое, менее вероятна: такие топонимы не зафиксированы в доступных исторических источниках. Зато прозвище Малюта известно по русской истории (Малюта Скуратов), хотя в фамилии Малюцкий оно даёт не ту суффиксальную форму.

Написание с мягким знаком (Малюцкий, а не Малюцкий) тоже показательно: оно отражает мягкость согласного [ц’] в белорусском и украинском произношении, где «ц» перед окончанием часто смягчается. В русском языке такое написание встречается реже, что ещё раз подтверждает юго-западное происхождение фамилии.

Таким образом, предки носителя фамилии Малюцкий — вероятно, выходцы из крестьянской или мещанской среды белорусско-украинского пограничья, получившие прозвище по признаку малого роста или младшего возраста. Фамилия недворянская, но с чёткой и прозрачной этимологией.