Фамилия Мамакеев — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не прозвище, а этноним или географическое название с тюркским корнем. Если отбросить фамильный суффикс -ев (указывающий на принадлежность, «сын такого-то»), остаётся основа «Мамакей». Этот элемент восходит к слову «мамак» — так в ряде тюркских языков (особенно в киргизском, казахском, алтайском) называли один из родов или племён. «Мамак» — это название родового подразделения, а «Мамакей» — его русифицированная форма, где -ей могло возникнуть как адаптация тюркского аффикса принадлежности.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с личным именем Мамакей — уменьшительной формой от Мамай или Мамед. Но против этого говорит редкость такого имени: в документах XVI–XVII веков встречаются отдельные упоминания «Мамакей», но массового распространения оно не получило. Версия с родовым названием выглядит убедительнее, потому что фамилия Мамакеев географически привязана к регионам, где кочевые племена сохраняли родоплеменную структуру до XIX века.

География фамилии подтверждает тюркское происхождение. Мамакеевы встречаются в Оренбургской области, Башкортостане, Татарстане, а также среди казахов и киргизов. В русском контексте фамилия закрепилась, скорее всего, через татарских или башкирских служилых людей, которые получали фамилии по названию своего рода при переходе на оседлость и вхождении в состав российского дворянства или казачества.

Интересная деталь: суффикс -ев, а не -ов, в фамилии Мамакеев указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или на -й. В тюркских языках конечный -й в слове «Мамакей» дал именно такой вариант. Это отличает фамилию от более частых «Мамаков» или «Мамакин», которые образованы от других основ (от имени Мамай или от слова «мамака» в значении «кормилица»).

Социальный статус первых носителей фамилии, скорее всего, был невысоким: родоплеменные названия редко давали дворянство, чаще их носили государственные крестьяне, казаки или однодворцы южных и восточных окраин России.