Фамилия Манахимов — один из тех случаев, где народная этимология перекроила церковное слово. В её основе лежит нарицательное «монах», которое превратилось в прозвище Монах. Почему не просто монах? Потому что настоящие монахи давали обет безбрачия и не могли иметь детей, а значит, и передавать фамилию. Прозвище Монах давали мирским людям — за смиренный нрав, богобоязненность, строгий образ жизни или даже за внешнее сходство с иноком.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Фамилия оформлена суффиксом -ов, но основа претерпела фонетическое изменение: «монах» превратилось в «Манах» через аканье (редукцию безударного «о»). В говорах, где чётко произносили «манах», прозвище закрепилось в таком виде, а затем к нему добавили фамильный суффикс. Получилась цепочка: Монах → Манах → Манахов → Манахимов. Вариант с -имов встречается реже, чем Манахов, и указывает на возможное влияние украинской или белорусской традиции, где суффикс -ич или -им мог наслаиваться на основу.

В ономастических справочниках (например, в работах Б. Унбегауна) фамилии на -имов обычно связывают с прозвищными формами, где -им- — это усечённый вариант притяжательного суффикса. То есть Манахимов буквально значило «сын того, кого звали Манахим». А Манахим — это уже просторечная форма от Манаха, то есть «монаха». Так что перед нами не одна, а две ступени народной переделки: сначала слово «монах» потеряло ударный слог, а потом к нему прирос дополнительный суффикс.

Географически фамилия редкая. Она не фиксируется в массовых списках дворянских или купеческих родов. Скорее всего, её носили крестьяне или мещане из центральной России или Поволжья, где акающие говоры — норма. Встречаемость низкая, что подтверждает: фамилия не возникла в крупных городах с книжной культурой, а сложилась в глубинке, устным путём.

Итог прост: предки человека с фамилией Манахимов — не монахи, а миряне, которых в деревне прозвали Монахами за их набожность или суровый нрав. Со временем прозвище обрасло типичными фамильными суффиксами, а произношение подчинилось местным диалектным законам.