Фамилия Мансурходжаев — редкий пример того, как русская суффиксальная модель наложилась на сложное арабо-персидское имя. В основе лежит составное личное имя Мансурходжа (Мансур-ходжа), где первая часть — арабское «Мансур» (победоносный, тот, кому дарована победа), а вторая — персидское «ходжа» (господин, хозяин, почётный титул, часто обозначавший купца или духовное лицо). Таким образом, имя-основа означает «победоносный господин» или «победоносный ходжа».

Суффикс -ев указывает на типично русский способ образования фамилий: от имени отца (патроним). Мансурходжаев — буквально «сын Мансурходжи». Написание через -ев, а не через -ов, объясняется тем, что основа оканчивается на мягкий согласный (в исходном имени — «дж»). В тюркских языках, через которые такие имена часто попадали в русскую среду, звук «дж» смягчается, поэтому суффикс закономерно принял форму -ев.

Географически фамилия Мансурходжаев почти наверняка связана с регионами Средней Азии — Узбекистаном, Таджикистаном, в меньшей степени с Казахстаном. Именно там титул «ходжа» был широко распространён среди потомков пророка Мухаммеда (сайидов) или просто уважаемых людей. Носители фамилии, скорее всего, происходят из узбекской или таджикской среды, где имя Мансурходжа давали мальчикам, желая им одновременно и воинской доблести (Мансур), и духовного авторитета (ходжа).

По сословной принадлежности предки Мансурходжаевых могли относиться к духовенству, купечеству или зажиточным крестьянам-ремесленникам. Титул «ходжа» в XIX — начале XX века в Средней Азии нередко передавался по наследству, поэтому фамилия могла закрепиться за целым родом, известным своей учёностью или торговлей. Встречаются варианты написания — Мансурходжаев, Мансур-Ходжаев, а также более русифицированная форма Мансуров, но коренное отличие именно в сохранении полного сложного имени в основе.