Фамилия Мануйленко образована от имени собственного и относится к распространенному типу украинских фамилий, на что указывает суффикс -енко. Фамилия Мануйленко образована от распространенного в старину мужского имени Иммануил (в переводе с древнееврейского – “с нами Бог”). Возможно, что в основу фамилии легло прозвище Мануйла, которым нарекали льстеца и обманщика. Покровителем имени Мануил (Иммануил) считался святой мученик Мануил, который вместе с Феодосием пострадали за веру во Христа в 304 году в Сирмии. Славяне же верили, что если дать ребенку имя святого или великомученика, то жизнь его будет светлой, хорошей или трудной, потому что существует незримая связь между именем и судьбой человека Уже в XV–XVI веках в среде богатых людей начинают закрепляться и передаваться из поколения в поколение фамилии, обозначающие принадлежность человека к конкретной семье. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Иммануил, со временем получил фамилию Мануйленко.