Фамилия Маньякин — один из тех случаев, когда первое впечатление обманчиво. Современное слово «маньяк» в значении «одержимый манией» не имеет к фамилии никакого отношения. Её корни уходят в славянскую языковую стихию, а не в греческую или медицинскую терминологию.

В основе фамилии лежит прозвище Маньяка. В русских говорах «маньяком» называли не больного человека, а актёра, комедианта, лицедея или фокусника. У В. И. Даля зафиксировано именно это значение: штукарь, тот, кто манит, вводит в заблуждение ради потехи. Глагол «манить» (обманывать, завлекать) и дал жизнь прозвищу. Следовательно, предок Маньякиных мог быть скоморохом, бродячим артистом или просто человеком с весёлым нравом, любившим разыгрывать окружающих.

Существует и вторая, более редкая версия. Словом «маньяк» в народе называли падающие звёзды. В этом случае прозвище могли дать ребёнку, родившемуся во время звездопада, — как внутрисемейное, пожелательное или памятное имя. Такая практика была распространена в славянской среде: ребёнка называли по природному явлению, случившемуся в момент его появления на свет. Оба объяснения равноправны, но первое — профессиональное — выглядит более конкретным и логичным для образования устойчивого прозвища.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Маньяк- добавился суффикс принадлежности -ин. Форма Маньякин означает «чей?» — сын или потомок Маньяки. Такая модель типична для центральной России и севера, где фамилии на -ин широко распространены.

Фамилия редкая, в дореволюционных переписях практически не встречается. Это говорит о том, что она могла бытовать локально, в одной или нескольких соседних деревнях, и не попала в массовые ревизские сказки. Окончательно установить точное место и время возникновения фамилии можно только через углублённые генеалогические изыскания в конкретных архивах.