Фамилия Манжурины образована от прозвища Манжура. Это типичная русская фамилия с суффиксом -ин, указывающим на принадлежность: «чей?» — «сын Манжуры». Само прозвище неоднозначно, и его происхождение объясняют по-разному.

Первая версия связывает прозвище с этнонимом «маньчжуры» — коренным народом Северо-Восточного Китая. Манжурой могли прозвать человека, который жил среди маньчжуров, торговал с ними или имел внешность, напоминавшую выходца из Маньчжурии. Однако эта гипотеза осложняется тем, что фамилия и прозвище Манжура довольно часто встречаются на Украине — далеко от границ Маньчжурии.

Вторая, более правдоподобная версия, связывает прозвище с крымским топонимом. Гора Манжул находится в Крыму, и человек, живший у её подножия, мог получить прозвище Манжура. Сам топоним, возможно, восходит к слову «манжули» — так называли каракалпаков племени ктай. В этом случае прозвище Манжура — вариант прозвища Манжула, и оба они указывают на географическое происхождение человека.

Таким образом, потомок человека по прозвищу Манжура со временем получил фамилию Манжурин. О точном месте и времени её возникновения говорить сложно: процесс формирования фамилий был длительным, и документальные свидетельства по этой фамилии пока не выявлены. Тем не менее, фамилия Манжурин — интересный пример того, как в основе русской фамилии может лежать и дальний этноним, и местный крымский топоним.