Фамилия Мараховский — одна из тех, где значение упирается в многозначное прозвище. В её основе лежит прозвище Марах или Мараха, а вот что оно означало — вопрос с двумя возможными ответами, и оба по-своему правдоподобны.

Первый вариант ведёт к глаголу «мараковать». В старину это слово имело двойной смысл: «плохо понимать, быть нерадивым в учении» и, наоборот, «смыслить, смекать, уметь делать дело». То есть Марахом или Марахой могли прозвать как тугодума, так и человека с практической сметкой — всё зависело от интонации и контекста. Второй корень — глагол «марать» (грязнить, пачкать). Тогда прозвище указывало либо на неопрятного человека, либо на профессию, связанную с грязной работой: печника, трубочиста, горняка.

Словообразовательная модель фамилии нестандартна. Суффикс -ов- указывает на русскую основу (Марах → Марахов), а затем добавлен суффикс -ский, характерный для польской и западнорусской традиции. Такая двойная конструкция — редкий случай. Обычно фамилии на -ский образовывались сразу от топонима или прозвища, а здесь мы видим наслоение: сначала появилось отчество Марахов, а потом его «ошляхтили» суффиксом -ский. Это может говорить о том, что носители фамилии переезжали из великорусских земель на территорию современной Украины или Белоруссии, где такая форма стала привычной, либо о том, что фамилия изначально формировалась под польским влиянием.

Фамилия встречается в документах XIX–XX веков, и география её бытования — юг и юго-запад Российской империи. В Книге памяти Омской области упоминаются Александр Данилович Мараховский (1887 года рождения, село Шулаевка) и Леонтий Гаврилович Мараховский (1890 года, село Пришиб Купянского уезда Харьковской губернии). В Книге памяти Краснодарского края есть запись об Алексее Антоновиче Мараховском (1908 года, станица Хамкетинская). Эти разрозненные сведения подтверждают, что фамилия бытовала в среде крестьян и казаков, а не только в шляхетских родах.