Фамилия Маракина — женская форма фамилии Маракин, а та, в свою очередь, образована от прозвища Марака. В основе этого прозвища лежит глагол «мараковать», который в старину имел двойственное значение. С одной стороны, «мараковать» означало «плохо понимать, быть недогадливым», и тогда Маракой могли назвать человека тугодума. С другой — этот же глагол мог означать «уметь, мочь что-то делать», то есть обладать практической сметкой, быть мастеровым. Потому прозвище могло закрепиться и за человеком с хозяйственной жилкой. Нельзя исключать и связь с глаголом «марать»: неопрятного, пачкотню или неряху тоже могли окликнуть Маракой.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Маракин — это «сын Мараки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и личных имён, оканчивающихся на -а или -я. Встречается фамилия Маракин в разных регионах, но чаще — в центральных и северных областях России, где были распространены говоры с этим глаголом. Таким образом, фамилия Маракина не имеет отношения к какому-то одному роду занятий: её носители могли происходить как от сообразительного умельца, так и от рассеянного или небрежного человека.