Фамилия Мараков образована от прозвища Марака. В основе лежит глагол «мараковать» — слово с двойным значением, которое бытует в русских говорах с XVII–XVIII веков. В одних диалектах «мараковать» означало «кое-как понимать, с трудом разбираться», в других, наоборот, «уметь, мочь, быть сметливым». Так что прозвище Марака могло достаться и человеку, который медленно соображал, и тому, кого считали практичным и умелым. Не исключено и влияние глагола «марать» — тогда Маракой называли неряху или пачкуна.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Мараков — потомок Мараки. Такая модель (прозвище + -ов) — самая распространённая в русских фамилиях, она закрепилась в XVI–XVII веках, когда крестьяне и посадские люди массово получали фамилии по отцу.

Географически фамилия встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье — там, где слово «мараковать» было особенно употребительно. Встречаются варианты написания: Мараков и Маракков (с удвоенной «к»), но последний редок.

Из носителей фамилии известен российский бард Леонид Мараков, но в целом фамилия нечастотная и не относится к числу широко распространённых.