Фамилия Мараковский звучит по-шляхетски, но её основа, скорее всего, чисто народная, прозвищная. Типичный суффикс -ский указывает на то, что она могла сформироваться у польской, белорусской или украинской шляхты, а также у духовенства, которое часто получало фамилии по названиям мест. Однако географической точки «Мараково» на картах Восточной Европы не так много, и все они невелики. Поэтому самый прямой путь — от прозвища Марак.

Слово «марака» в южнорусских и украинских говорах имело два ярких значения. Первое — «разиня», «неловкий человек», от глагола «маракать» (делать кое-как). Второе, более тёмное — «призрак», «наваждение», то же, что и «мара». В этом случае прозвище Марак могли дать человеку с неспокойным, мрачным нравом или, напротив, тому, кто якобы «видел мороку» и считался колдуном. В польском языке есть слово «marak» — «ворчун», «брюзга», что тоже укладывается в логику прозвища.

Если же отталкиваться от топонима, то фамилия могла закрепиться за выходцем из села Мараково. Такие названия есть в Могилёвской области Беларуси и в бывшей Витебской губернии. В этом случае первый носитель — Мараковский — был либо мелким помещиком, владевшим этим хутором, либо крестьянином, переселившимся оттуда и получившим фамилию по месту прежнего жительства.

Стоит заметить, что в русской среде фамилия могла возникнуть и без польского влияния. В северных говорах «мараковать» означало «соображать», «понимать». Человека, который «маракует» в деле, могли прозвать Мараком, а его потомки уже становились Мараковскими — по модели, характерной для крестьянских фамилий на -ский, которые иногда давали грамотные священники или приказчики.

Таким образом, у фамилии Мараковский два равноправных ключа: либо она указывает на предка с необычным прозвищем (от «мары»-призрака до «мараки»-разини), либо на конкретную деревню. Сословный состав носителей был смешанным: среди Мараковских встречались и священники, и мещане, и крестьяне.