Фамилия Маралин образована от прозвища Марала. Основа — глагол «марать», то есть «пачкать, грязнить, чернить, мазать». Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Маралы. Такая модель типична для русских фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей: от уличного прозвища отца образовывали фамилию для всей семьи.

Прозвище Марала могло закрепиться за человеком по разным причинам. Самая прямая — род занятий, связанный с грязной или тяжёлой физической работой: кузнец, печник, землекоп, красильщик. Одежда такого мастера постоянно была в саже, глине или краске. Другая версия — характер или привычки. Маралой могли назвать неаккуратного человека, который вечно ходил испачканным, или рассеянного писца, которому приходилось много раз переписывать и замарывать листы. В быту так могли прозвать и непоседливого ребёнка, который везде лез и пачкался.

Фамилия Маралин встречается редко. Её география неширокая: отдельные записи есть в центральных областях России и на Урале. По сравнению с однокоренными фамилиями — Мараев, Маралов, Маракин — Маралин сохранила более прозрачную связь с исходным прозвищем, без дополнительных суффиксов переоформления. Со временем прозвище Марала закрепилось за человеком как наиболее употребительное именование, а затем легло в основу фамилии Маралин. Таким образом, потомок человека с таким прозвищем получил фамилию, которая прямо отвечает на вопрос: чей ты будешь? — Маралин.