Фамилия Марапова — женская форма, а её основа мужская — Марапов. В русской модели образования фамилий суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Марапа». Значит, в основе лежит личное или прозвищное имя Марап.

Сам корень «марап» — редкий и неоднозначный. Первая и самая вероятная версия связывает его с тюркскими языками, где «марап» могло быть вариантом слова «мараб» или «мараба» — в ряде тюркских диалектов так называли умелого мастера, ремесленника, а иногда и просто «работягу». В таком случае Марап — прозвище человека по профессии или качеству: искусный кузнец, плотник или просто трудолюбивый человек. Тюркское происхождение подтверждается и географией: фамилия Марапов встречается в Татарстане, Башкортостане, а также среди казахов и ногайцев, где суффикс -ов типичен для русифицированных фамилий.

Вторая версия, менее распространённая, выводит Марапа из арабского имени Мараб (от «раба» — близкий, сосед), но тогда исходная форма должна была бы звучать как Марабов, а не Марапов. Возможно, это диалектное искажение при записи в метрических книгах — такое случалось с именами, которые не имели устоявшегося написания в русской традиции.

Встречается фамилия и в славянском контексте, но крайне редко. Если отбросить тюркскую версию, можно предположить, что Марап — это прозвище от глагола «марать» (пачкать), но суффикс -ап нехарактерен для русских прозвищ, и такое объяснение выглядит натянутым.

Таким образом, предки носителя фамилии Марапов, скорее всего, были тюркоязычными ремесленниками или крестьянами, получившими прозвище по мастерству. Фамилия не принадлежала к дворянским родам — в дореволюционных списках она не фиксируется среди столбового дворянства, что указывает на её простонародное, крестьянское или мещанское происхождение.