Фамилия Марготьев — редкий случай, когда за привычным русским суффиксом -ев скрывается не славянское, а французское имя. Основа фамилии — женское имя Марго, которое в русском языке закрепилось как уменьшительная форма от Маргарита (от греч. «жемчужина»). В XVIII–XIX веках французская культура сильно влияла на дворянский и купеческий быт, и имена вроде Марго, Жанно, Луиза нередко давали детям в семьях, желавших подчеркнуть образованность и европейский лоск.

Суффикс -ев указывает на классическую модель русской фамилии: «чей?» — Марготьев, то есть сын или потомок Марго. Обычно так образовывали фамилии от крестильных имён, прозвищ и профессий, но здесь основа — женское имя. Это не типично: большинство русских фамилий пошли от мужских имён (Иванов, Петров). Фамилия Марготьев могла возникнуть, если отца звали Марго (что маловероятно для паспортного имени) или если главу семьи в деревне прозвали по жене или дочери — Марготиха, а детей записали как Марготьевы. Такая модель «от материнского имени» встречается, но редко и часто связана с внебрачным рождением или особым положением женщины в хозяйстве.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Поволжью. В дореволюционных метрических книгах Марготьевы встречаются в Саратовской, Астраханской и Воронежской губерниях — регионах, где в XIX веке селились иностранные специалисты и обрусевшие французы. Не исключено, что предок носителя фамилии был из числа пленных французов 1812 года, оставшихся в России, или гувернёром, который прижился в поместье и получил фамилию по своему домашнему имени. Прямых указаний на дворянство нет: суффикс -ев в этой фамилии не аристократический, а бытовой, крестьянский или мещанский.

Словообразовательно фамилия проста: корень Маргот- (Марго + т, где «т» могло появиться как вставка для благозвучия или под влиянием других фамилий на -отов) плюс суффикс -ев. Встречается вариант Марготин — он образован по той же модели, но с суффиксом -ин, что тоже допустимо для имён на -а. Оба варианта редки, и Марготьев — самый необычный, так как сохраняет мягкое окончание основы.