Фамилия Марильтуева — редкая, и её происхождение почти наверняка связано с этническими меньшинствами Сибири, а не с привычной для европейской России моделью «от имени + суффикс». В ней сразу обращает на себя внимание основа «Марильту-», которая не похожа ни на славянский корень, ни на тюркское или монгольское имя. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая в среде алтайцев, тувинцев или хакасов, где есть родовые имена и прозвища с похожей фонетикой.

Разбирать её по схеме «корень + суффикс» бессмысленно, пока не понять, что стоит в основе. Наиболее вероятная версия: «Марильту» — это русифицированная запись какого-то местного имени или прозвища. Например, в алтайском языке есть слово «марыл» (или «марылту») — так называют вид дикой кошки, манула. Прозвище «Марылту» могли дать человеку с округлым лицом, густыми бровями или скрытным, осторожным нравом — по ассоциации с этим зверем. Суффикс «-ева» — чисто русский, притяжательный, его добавили при оформлении фамилии по паспорту, вероятно, в XIX–XX веках, когда коренное население Сибири массово получало фамилии по отцу или роду.

Есть и другая, менее правдоподобная версия: основа могла произойти от бурятского или монгольского имени Марилту (с ударением на первый слог), где «марил» — это вариант имени Мария, адаптированный под местное произношение. Но это спорно, так как христианское имя Мария в степных районах среди шаманистов и буддистов встречалось редко, и даже если бы попало, скорее дало бы форму «Мариин» или «Мариев», а не «Марильту».

Географически фамилия почти не встречается за пределами Республики Алтай и соседних регионов. Если вы носите эту фамилию, ваши предки, скорее всего, жили в горной тайге или предгорьях, занимались охотой или скотоводством, и фамилия закрепилась за родом уже в советское время, когда всех обязали иметь документы. Никакого дворянства или купечества за ней не стоит — это чисто народная, сибирская ойконимическая фамилия, сохранившая в себе звучание языка, который почти не оставил письменных следов.