Фамилия Маринкова — женская форма от Маринков, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс -ов- здесь указывает на притяжательное значение: буквально «чей?» — «Маринков», то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Маринок. Такая модель типична для восточнославянских фамилий, где ударение в женской форме обычно остаётся на том же слоге, что и в мужской: Маринкóв → Маринкóва.

Основа Маринок — это уменьшительно-ласкательная форма от мужского имени Марин. Само имя Марин — редкая русская народная форма канонического имени Марин, которое восходит к римскому родовому имени Marinus (от лат. marinus — «морской»). В святцах имя Марин встречается, но в быту его часто переделывали в более привычные Марин, Мариня, Мариша. Таким образом, Маринок — это «маленький Марин», а Маринков — его потомок.

Географически фамилия Маринков (и Маринкова) тяготеет к южнорусским и украинским областям, а также встречается у болгар и сербов. В русской ономастике суффикс -ок в основе (Маринок) характерен для прозвищного или имени-оберега: так могли назвать младшего сына, чтобы «обмануть» нечистую силу, или же это было домашнее прозвище, закрепившееся в официальной записи. В болгарском и сербском языках фамилии на -ов от имён с суффиксом -ок ещё более распространены, поэтому нельзя исключать и южнославянские корни.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда её путают с Маринковой от женского имени Маринка, но это ошибка: женские имена редко давали основу для фамилий на -ов, если только речь не о внебрачном ребёнке или особом прозвище матери. Правдоподобнее всего связь именно с мужским именем Марин, которое в уменьшительной форме Маринок и дало фамилию. Сословной привязки у неё нет: носители Маринковых могли быть и крестьянами, и мещанами, и казаками — фамилия слишком распространённой модели, чтобы говорить о каком-то одном социальном слое.