Фамилия Маринкина образована от женского имени Маринка — уменьшительной формы канонического имени Марина. Само имя Марина (от латинского marinus — «морская») пришло на Русь вместе с христианством, а его просторечная форма Маринка в XVI–XVII веках была распространена в крестьянской и посадской среде. Именно от этой обиходной версии и возникла фамилия: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Маринкина буквально означает «дочь или жена Маринки».

В ономастике фамилии на -ин чаще всего образовывались от основ, оканчивающихся на -а/-я, и Маринкина — типичный пример такой модели. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые преобладают в северных и центральных губерниях, фамилии на -ин более характерны для южнорусских и поволжских областей. Поэтому предки носительницы фамилии могли происходить, например, из рязанских, тамбовских или саратовских земель, где форма Маринка бытовала особенно широко.

Интересно, что в старинных писцовых книгах и переписных листах XVII века встречаются записи «Маринка Иванова дочь» или «Маринка Федоров сын», где имя выступает без фамильного суффикса. Лишь в XVIII–XIX веках, когда фамилии стали закрепляться наследственно, форма Маринкина превратилась в родовое прозвание. Таким образом, в основе фамилии лежит не прозвище или ремесло, а именно личное имя, что делает её «матримониальной» по происхождению — то есть указывающей на родство с конкретной женщиной по имени Маринка.

Споров вокруг этимологии немного: альтернативная версия, связывающая фамилию с диалектным словом «маринка» (в некоторых говорах — «черника» или «мелкая рыба»), маловероятна, так как такие прозвища давали редко и они не породили массовой фамилии. Основной и надёжный источник — имя Марина в его уменьшительной форме.