Фамилия Маркеева образована от имени Маркей — народной, разговорной формы нескольких крестильных имён: Марк, Маркелл или Маркиан. Все они восходят к латинскому корню, связанному с Марсом, богом войны, и означают «мартовский», «воинственный». У имени Марк есть и другое толкование — от латинского malleus («молот») или marceo («увядать»), но для фамилии Маркеева ключевая именно уменьшительная, обиходная форма, которую использовали в повседневной речи, а не в церковных записях.

Такая модель — отпадение конечного -л или -ан и добавление суффикса -ей — типична для русских имён XVI–XVII веков: Маркей, Васей, Петрей. В официальных документах эти варианты встречаются реже полных имён, но именно они часто становились основой для фамилий простых людей. Притяжательный суффикс -ев указывает на принадлежность: Маркеев — «сын Маркея». Форма Маркеева — женский вариант той же фамилии, закрепившийся в паспортной системе.

Носители фамилии Маркеева встречаются по всей России, но заметно чаще — в Поволжье и центральных областях. В переписных книгах XVII века Маркеевы упоминаются среди крестьян и посадских людей, что подтверждает догадку: предки были не из знати, а из тягловых сословий. Фамилия не редкая, но и не массовая — её географическая привязка к определённым уездам говорит о том, что род мог долго жить на одном месте, не смешиваясь с другими ветвями.