Фамилия Марьков — один из тех случаев, когда внешняя простота обманчива. На первый взгляд, перед нами типичная патронимическая фамилия на -ов, образованная от имени Марк. Но в русской традиции имя Марк давало фамилии Марков, а не Марьков. Разница в одной букве — и в корне меняет историю.

Ключ к разгадке — в народной форме имени Марья. В разговорной речи, особенно в южнорусских и украинских говорах, имя Мария часто звучало как Марья. От него образовали уменьшительные формы Марька, Марько. Фамилия Марьков — это буквально «сын Марьки» или «сын Марько». То есть основа здесь не мужское имя Марк, а женское Мария в его обиходном варианте. Такое случалось: если в семье главой двора долгое время оставалась вдова или сильная хозяйка, детей могли записывать по матери — «Марьины дети», а затем и «Марьковы».

Словообразовательная модель стандартна: суффикс -ов присоединился к основе Марьк-. Фамилия относится к числу так называемых «матронимических» — образованных от женского имени, что в целом редкость для русских фамилий. По той же модели возникли, например, Марьин, Марьичев, но Марьков стоит особняком: он указывает не на принадлежность матери («чей?»), а на родство по отцу («сын Марьки»), где Марька — уже прозвище или имя самого предка-мужчины, полученное им по матери.

Географически фамилия тяготеет к югу России и к Украине. Встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях, а также на Кубани — там, где аканье и мягкое произношение давали форму «Марько» вместо «Марко». В письменных источниках XVII–XVIII веков можно найти упоминания о крестьянах и казаках с такой фамилией, но массового распространения она не получила, оставшись локальной.

Версия о происхождении от имени Марк через промежуточную форму «Марьк» (с мягким знаком) маловероятна: в русской ономастике имя Марк последовательно давало фамилию Марков, и лишь в единичных случаях, при искажении в документах, возникали варианты вроде Марьков, но они не закреплялись как основные. Так что самая правдоподобная история — та, что ведет к Марье.