Фамилия Маркварт — одна из тех, что пришли в Россию вместе с немецкими колонистами, ремесленниками и офицерами, оседавшими в разных губерниях начиная с XVIII века. Её основа — прозвище, которое сложилось из двух нижненемецких слов: mark (пограничная область) и ward (охрана, стража). Проще говоря, Маркварт — это «страж границы». Такое именование давали человеку по профессии: в средневековой Германии так могли назвать того, кто нёс службу на рубежах земли или княжества, охранял марку — пограничное владение.

Но у этой фамилии есть и второй, менее очевидный, пласт значений. В немецком фольклоре и диалектах Маркварт — это сойка. Птица яркая, крикливая, заметная. Не исключено, что в отдельных случаях прозвище давали не по работе, а по внешнему сходству или повадкам: например, человеку с пёстрой одеждой, резким голосом или беспокойным характером. Такая двойственность — профессиональное имя или прозвище по птице — встречается у немецких фамилий нередко (вспомним хотя бы Финка — зяблика или Шперлинга — воробья).

Словообразовательная модель здесь простая: фамилия застыла в форме чистого прозвища без русских суффиксов -ов, -ин или -ский. Это характерный признак фамилий немецкого происхождения, которые вошли в русский обиход без адаптации, в исходном виде. В документах XIX века Маркварты встречаются среди колонистов Поволжья, прибалтийских немцев, а также в среде петербургских и московских мастеровых и аптекарей.

Споров о происхождении корня почти нет: обе версии — и «страж границы», и «сойка» — имеют под собой лингвистическую основу. Первая выглядит более убедительной, потому что сложные имена с компонентом ward (стража) типичны для древневерхненемецкой и средневековой антропонимии: ср. Ландверт, Хартварт, Зигварт. Вторая версия — народно-диалектная, менее распространённая, но вполне реальная для прозвищ, данных в быту.

В русском контексте фамилия Маркварт почти не меняла написания, хотя в метрических книгах можно встретить варианты Марквардт или Маркворт — следы разного произношения в немецких диалектах. Сегодня носители фамилии живут в основном в крупных городах России, а также в Германии и Казахстане, куда фамилия попала с волнами миграций.