Фамилия Маршенин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии послужило имя Маршеня, а суффикс -ин указывает на принадлежность: Маршенин — это «сын Маршени», потомок человека с таким именем. Такая модель типична для русских фамилий, но сам корень здесь необычен, и вокруг него сложилось несколько версий.

Наиболее вероятное объяснение связывает фамилию с еврейской традицией имянаречения. В еврейской среде устоялась практика составлять имена из начальных букв или слогов других слов. Основа Марш- в фамилии Маршенин, очевидно, восходит к выражению «морену рабейну Шломо», то есть «учитель наш (господин наш) Соломон». Сокращенное имя Марш, а затем и его уменьшительная форма Маршеня, легли в основу фамилии. Эта версия выглядит правдоподобной, поскольку аббревиатуры такого рода были распространены в еврейских именах, а фамилии на -ин активно усваивались в русскоязычной среде.

Существует и ряд менее правдоподобных гипотез. Согласно одной из них, фамилия образована от прозвища Маршеня, которое дали человеку, ходившему гордо, важно или быстро, то есть «маршировавшему». Это бытовое объяснение привлекает простотой, но не объясняет, почему именно такая форма прозвища закрепилась. Возможно и то, что фамилия произошла от украинского «маршi» — в этом случае она указывала бы на место обитания предка, но такая привязка остается слишком зыбкой и не подкреплена географическими данными.

О точном месте и времени возникновения фамилии Маршенин говорить сложно: процесс формирования фамилий был длительным, а письменные источники по таким редким именам отрывочны. Тем не менее, фамилия Маршенин — живой памятник славянской письменности и культуры, в котором переплелись разные традиции имянаречения, и именно эта многослойность делает ее особенно интересной для изучения.