Фамилия Машкин (и её вариация Машкины) в большинстве случаев — это отчество, образованное от женского имени. Вопреки распространённому шаблону, когда русские фамилии происходят от имён отцов, здесь основа — краткая форма имени Мария: Маша или, в более просторечном, даже сниженном варианте, Машка.

Имя Мария пришло на Русь с христианством из древнееврейского языка, где означало «госпожа», «желанная» или «любимая». Но для понимания фамилии важнее не перевод, а социальный контекст. Патронимические фамилии от женских имён — редкость для русской традиции. Они появлялись, когда женщина становилась фактической главой семьи: вдовствовала, вела хозяйство или воспитывала детей без мужа. Сына такой женщины соседи и писари могли называть «Машкин сын», а закрепившись, это прозвище превращалось в фамилию для целого рода.

Впрочем, есть и вторая, более прозаичная версия. В некоторых говорах «машкой» называли не только Марию, но и, например, кошку или даже медведицу. Однако для фамилии эта версия маловероятна: прозвища от кличек животных редко образовывались через суффикс -ин от женского рода. Гораздо логичнее выглядит связь с именем, тем более что суффикс -ин в данном случае указывает на принадлежность: «чей?» — Машкин.

Сам суффикс -ин в русской ономастике типичен для основ, оканчивающихся на -а/-я. Если бы фамилия произошла от мужского имени Машко (гипокористика от Матвей или Мамант), она звучала бы так же — Машкин. Это создаёт редкую омонимию: не всегда можно точно сказать, от женского или мужского имени пошёл род, но обе версии укладываются в нормы словообразования.

Фамилия фиксируется в документах с XVII века, преимущественно в центральных и северных русских землях, где была сильна традиция уличных фамилий. В переписных книгах встречаются крестьяне и посадские люди с этим прозвищем, что говорит о её недворянском, «народном» происхождении. Позже фамилия распространилась по всей России, но сохранила оттенок простонародности.

Таким образом, Машкин — это памятник не столько письменности, сколько живого языка: он сохранил ту форму имени, которая в литературной речи давно вытеснена нейтральной «Маша». Фамилия — редкий случай, когда в ней застыло не только имя, но и семейный уклад, где женщина играла решающую роль.