Фамилия Матронин образована от старинного русского женского имени Матрена (Матрона). Оно восходит к позднелатинскому имени Матрона, которое в переводе на русский язык означает «знатная, почтенная женщина». В результате, потомок женщины, обладающей именем Матрона, со временем получил фамилию Матронин.