Фамилия Мавлекаев — редкая, с неочевидной на первый взгляд корневой основой. Её разбор упирается в имя или прозвище Мавлякай / Мавляка, которое могло возникнуть в татаро-башкирской или казахской среде.

Скорее всего, в основе лежит арабское имя Мавля (Мауля, Mawlā), означающее «господин», «владыка», «покровитель». В исламской традиции это один из эпитетов Аллаха, а также почтительное обращение к духовному наставнику. Уменьшительно-ласкательная форма с тюркским аффиксом -кай (Мавлякай) дала прозвище «маленький господин» или, по другой версии, «сын Мавли». Русский суффикс -ев присоединился уже при оформлении фамилии по русской модели: Мавлекаев буквально — «потомок Мавлякая».

Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, что подтверждает её тюрко-мусульманские корни. Сословно предки могли быть муллами, учителями медресе или просто уважаемыми в общине людьми — имя Мавля давали не случайно, а с намёком на благочестие или учёность.

Интересная деталь: написание через «а» после «л» (Мавлекаев, а не Мявлекаев) указывает на твёрдое произношение в тюркском оригинале. Встречаются варианты Мавлякаев, Маулякаев — это уже следы разной записи одного и того же имени в метрических книгах.

Иных версий, кроме как от арабско-тюркского имени, у фамилии нет: попытки связать её с русским глаголом «маять» или словом «мавка» (русалка) лингвистически несостоятельны из-за несоответствия суффиксальной модели.