Фамилия Мавлекеев — тюркская по происхождению, образованная от личного имени Мавлеке (вариант Мавлике, Мавлюке). В основе лежит арабское слово «мауля» (господин, владыка, покровитель), которое в тюркской среде приобрело форму Мавлюд или Мавлюк — имя, нередко даваемое мальчикам, родившимся в месяц маулюд (месяц рождения пророка Мухаммеда). Суффикс -еев — это русская патронимическая приставка, адаптированная к тюркскому корню: в татарской и башкирской традиции фамилии на -ев/-ов образовывались от имён отцов, поэтому Мавлекеев буквально означает «сын Мавлеке».

Корень фамилии — Мавлеке — встречается в нескольких фонетических вариантах: Мавлюкей, Мавлюков, Мавлеев. В отличие от более распространённых Мавлюкеев или Мавлютов, форма Мавлекеев тяготеет к западно-тюркским говорам, где редуцировался гласный «ю» — так что исходное имя могло звучать как Мавлүкәй или Мавләкәй. Такое имя было популярно у татар, башкир и некоторых народов Поволжья, особенно в XIX веке, когда арабские имена с религиозным оттенком активно замещали древние тюркские.

По сословной принадлежности носители фамилии, скорее всего, относились к государственным крестьянам или мещанам — в метрических книгах Казанской, Уфимской и Оренбургской губерний фамилия Мавлекеев фиксируется с середины XIX века. Дворянских родов с такой фамилией не известно, что типично для поздних патронимов, закреплённых после ревизий 1830–1850-х годов.

Интересная деталь: в некоторых записях фамилию писали через «и» — Мавликеев, что отражает местное произношение, где гласный первого слога звучал ближе к «и», чем к «е». Такое варьирование — не ошибка писаря, а живая фонетика, сохранившаяся в говорах казанских татар. Сегодня фамилия встречается преимущественно в Татарстане, Башкортостане, а также в Челябинской и Оренбургской областях — регионах исторического расселения тюркского населения.