Фамилия Мавлюкеева — женская форма фамилии Мавлюкеев, и её происхождение напрямую связано с мусульманским именем Мавлюкей. Это имя, в свою очередь, восходит к арабскому слову «маулюк» — «обладаемый», «раб», но в переносном значении, принятом в тюркской среде, оно означало «раб Божий», то есть человека, покорного Всевышнему. Имена с таким корнем (Мавлюд, Мавлюка, Мавлюкей) были популярны среди татар и башкир, и именно в Волго-Уральском регионе фамилия Мавлюкеева встречается чаще всего.

Словообразовательная модель проста и типична для русского языка: к татарскому имени Мавлюкей добавили русский патронимический суффикс -ев, который указывает на принадлежность («чей?» — «Мавлюкеев сын»). Окончание -а в женской форме — стандартное для фамилий, не склоняющихся по падежам в мужском роде, но меняющихся в женском. Такое сочетание тюркского корня и славянского суффикса — характерная черта фамилий, возникших у крещёных татар или у тех, кто жил в тесном контакте с русским населением, например, в Казанской, Уфимской или Оренбургской губерниях.

В отличие от многих фамилий на -ов/-ев, которые образованы от полных крестильных имён, Мавлюкеева сохраняет прямую связь с доисламским или раннеисламским именем, не адаптированным под православный календарь. Это указывает на то, что предки носительницы фамилии, скорее всего, были мусульманами, а фамилию зафиксировали уже в русскоязычных документах — при переписях или в метрических книгах, где требовалось указать отчество или прозвище по отцу.

Сложностей в этимологии нет: корень прозрачный, суффикс стандартный. Редкость фамилии объясняется не уникальностью имени, а локальностью её бытования — она почти не встречается за пределами Татарстана, Башкортостана и соседних областей. Никакой связи с ремёслами, географическими названиями или прозвищами здесь нет: это чистая патронимия, «сын Мавлюкея», и это главное, что можно сказать о её происхождении.