Фамилия Маврушин образована от имени или прозвища Мавруша. В основе лежит мужское крестильное имя Мавр, которое пришло из древнегреческого со значением «тёмный». Мавруша — одна из уменьшительных или обиходных форм этого имени, и именно она дала жизнь фамилии с типичным русским суффиксом принадлежности -ин (отвечает на вопрос «чей?»: сын Мавруши).

Есть и альтернативная версия: прозвище Мавруша могли дать не по имени, а по внешнему сходству с маврами — народом, исторически населявшим Мавританию. В этом случае прозвище получал человек со смуглой кожей, тёмными волосами или просто чем-то напоминавший мавров. Обе версии сходятся на том, что корень фамилии связан с «тёмным» или «южным» обликом, но первая, через крестильное имя, выглядит более вероятной: имя Мавр было в святцах и давалось при крещении, а прозвище по этническому признаку встречалось реже и чаще оставалось в устном обиходе.

Фамилия Маврушин — сравнительно редкая, что типично для фамилий, образованных от не самых распространённых имён. Её словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на прямое родство с человеком по имени или прозвищу Мавруша. Встречается фамилия преимущественно в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает её связь с крестильным именем, бытовавшим в среде православных крестьян.