Фамилия Мазникер звучит на русский слух необычно, и это не случайно: её происхождение не славянское, а еврейское. В основе лежат два немецких или идишских корня: «Masse» (мера, количество) или «Mass» (мера, размер) и «-niker» — суффикс, указывающий на профессию или род занятий. Буквально Мазникер — это «мерщик», человек, который занимается измерением, возможно, землемер или контролёр мер и весов. Вторая, менее вероятная версия, связывает первую часть с идишским «мазн» (мазь) — тогда фамилия могла означать «аптекарь» или «изготовитель мазей». Однако более правдоподобна первая трактовка, так как суффикс «-никер» в ашкеназских фамилиях часто указывает на ремесло.

Словообразовательная модель здесь нетипична для русских фамилий: окончание -ер вместо привычных -ов, -ин или -ский. Это типично для фамилий, возникших в черте оседлости Российской империи, где еврейское население в конце XVIII — XIX веках часто получало фамилии от немецких или идишских корней по профессиональному признаку. Мазникер — не переделка русского прозвища, а прямая калька с немецкого диалекта.

Географически фамилия редкая и встречается преимущественно в записях о еврейских общинах Украины, Беларуси и Польши — там, где была высока концентрация носителей идиша. В дореволюционных метрических книгах можно найти варианты написания: Мазникер, Масникер или Мазнекер, что связано с разной передачей звуков на письме.

В отличие от многих русских фамилий, Мазникер не имеет сословной привязки — её носителями были в основном ремесленники, торговцы или мелкие служащие. Фамилия не потерялась в советское время, хотя и осталась малочисленной. Сегодня она может встречаться в России, Израиле, США и Германии, но её обладателей по-прежнему немного. Для тех, кто носит эту фамилию, она — прямое указание на профессию предка, который, скорее всего, был человеком точным и ответственным: мерил землю или товары.