Фамилия Мекушова — одна из тех, где географический ключ оказывается важнее морфологического. Суффикс -ов указывает на русскую модель образования от мужской основы Мекуш, но сама основа звучит нетипично для центральной России и скорее ведет на Кавказ, в частности в Осетию.

Скорее всего, в основе лежит осетинское имя или прозвище Мекуш. В осетинском языке есть корень «мек» (мæк), который может означать «баран» или «овца» в диалектных формах. Однако более вероятна связь с личным именем: у осетин встречается мужское имя Мекуш, которое могло быть уменьшительным от более длинного (например, от «Мекур» или «Меки»). Носитель такого имени — предок-осетин, который затем обрусел, и его потомки получили фамилию по отцу: «чей?» — Мекушов.

Второй вариант, менее вероятный, но возможный для южных регионов России: основа от тюркского слова «мек» (крепость, твердость) или от глагола со значением «защищать». Тогда Мекуш — человек крепкий, защитник. Но осетинская версия выглядит убедительнее, так как фамилия с таким корнем встречается в записях по Северной Осетии и соседним областям.

Суффикс -ов в данном случае — чисто русский патронимический формант, который «пришили» к нерусской основе при оформлении фамилии в документах XIX–XX веков. То есть перед нами не исконно славянская фамилия, а результат межэтнического контакта: осетинская основа, обработанная русской фамильной моделью. Фамилия редкая, не массовая, и её носители, скорее всего, имеют корни в предгорьях Кавказа.